Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF4Q9BUZ4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms