Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms