Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms