Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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