Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms