Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms