Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms