Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms