Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms