Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms