Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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