Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms