Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms