Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms