Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM4SF18Q96CE8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms