Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAVIN3Q969G5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms