Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms