Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms