Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC4Q8TBB5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms