Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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