Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
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CLDN19Q8N6F1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN19Q8N6F1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN19Q8N6F1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN19Q8N6F1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN19Q8N6F1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN19Q8N6F1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN19Q8N6F1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN19Q8N6F1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLDN19Q8N6F1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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CLDN19Q8N6F1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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CLDN19Q8N6F1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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CLDN19Q8N6F1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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CLDN19Q8N6F1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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CLDN19Q8N6F1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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