Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVOPQ8N4V2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVOPQ8N4V2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms