Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC24Q8N4L8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC24Q8N4L8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms