Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms