Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG3Q6UXM1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG3Q6UXM1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms