Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSTM1Q6UX27 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VSTM1Q6UX27 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms