Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms