Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms