Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms