Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms