Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms