Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 GTPBP2-209ENST00000480263 898 ntTSL 211.09□□□□□ -0.631e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 GTPBP2-205ENST00000442748 946 ntTSL 310.68□□□□□ -0.71e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 SLC6A8-208ENST00000467402 308 ntTSL 510.68□□□□□ -0.71e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 SLC6A8-205ENST00000442457 523 ntTSL 310.5□□□□□ -0.731e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 PIM1-203ENST00000479509 675 ntTSL 210.23□□□□□ -0.771e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 PIM1-202ENST00000468243 818 ntTSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.911e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.991e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 DNAJC21-204ENST00000509626 779 ntTSL 2-0.88□□□□□ -2.551e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 DDX39A-207ENST00000588542 1297 ntTSL 317.03■□□□□ 0.322e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 TLE3-217ENST00000559574 325 ntTSL 516.01■□□□□ 0.152e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 DDX39A-206ENST00000587730 1813 ntTSL 1 (best)12.8□□□□□ -0.362e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 DDX39A-208ENST00000588692 1478 ntTSL 512.64□□□□□ -0.392e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 DDX39A-217ENST00000592391 1080 ntTSL 512.38□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 DDX39A-209ENST00000589318 1903 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.582e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 DDX39A-219ENST00000592927 823 ntTSL 310.87□□□□□ -0.672e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.692e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.772e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.82e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 TLE3-225ENST00000561453 3719 ntTSL 59.65□□□□□ -0.872e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 DDX39A-202ENST00000324340 1355 ntTSL 1 (best)9.57□□□□□ -0.882e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 DDX39A-203ENST00000454233 922 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.922e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 BRD8-222ENST00000506167 1363 ntTSL 57.93□□□□□ -1.142e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 BRD8-223ENST00000511898 586 ntTSL 56.73□□□□□ -1.332e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 SF3B6-202ENST00000478050 720 ntTSL 24.03□□□□□ -1.762e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 BRD8-225ENST00000515014 726 ntTSL 52.35□□□□□ -2.032e-7■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 SMC4-215ENST00000484799 478 ntTSL 2-0.9□□□□□ -2.556e-17■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 TMEM214-213ENST00000495312 804 ntTSL 224.42■■□□□ 1.55e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.25e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 AURKAIP1-205ENST00000489799 695 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.775e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 SH3GLB2-204ENST00000416230 720 ntTSL 219.47■□□□□ 0.715e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 MCM3AP-203ENST00000426537 876 ntTSL 219.15■□□□□ 0.665e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.525e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.495e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 PKP4-209ENST00000479398 550 ntTSL 517.73■□□□□ 0.435e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 317.52■□□□□ 0.41e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 DGCR8-204ENST00000457069 770 ntTSL 317.52■□□□□ 0.391e-10■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 AURKAIP1-206ENST00000496905 608 ntTSL 216.75■□□□□ 0.275e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-219ENST00000601336 754 ntTSL 216.33■□□□□ 0.21e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.145e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.15e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 515.47■□□□□ 0.071e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.045e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 214.47□□□□□ -0.091e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.121e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 TMEM214-202ENST00000321326 2700 ntTSL 214.1□□□□□ -0.155e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.165e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 CTSB-222ENST00000531551 1855 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 HSPA9-206ENST00000506477 664 ntTSL 213.82□□□□□ -0.21e-12■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.21e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.215e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.225e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.225e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 HSPH1-208ENST00000629751 1034 ntTSL 213.55□□□□□ -0.245e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.245e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 PGGHG-207ENST00000482937 734 ntTSL 513.4□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-215ENST00000601107 671 ntTSL 313.28□□□□□ -0.285e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 OAZ1-208ENST00000592727 726 ntTSL 213.22□□□□□ -0.291e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 LDHA-209ENST00000478970 732 ntTSL 213.21□□□□□ -0.291e-10■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.315e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-208ENST00000598550 771 ntTSL 513.08□□□□□ -0.315e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-212ENST00000599537 833 ntTSL 513.08□□□□□ -0.315e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.325e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.345e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 212.84□□□□□ -0.351e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-216ENST00000601340 2197 ntTSL 212.64□□□□□ -0.395e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 HSPA9-205ENST00000505110 518 ntTSL 412.57□□□□□ -0.41e-12■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-206ENST00000598296 529 ntTSL 312.14□□□□□ -0.475e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.475e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-203ENST00000594932 602 ntTSL 512.1□□□□□ -0.475e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-214ENST00000601015 697 ntTSL 512.1□□□□□ -0.475e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 CTSB-203ENST00000420692 2230 ntTSL 211.92□□□□□ -0.55e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.545e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 LDHA-213ENST00000535451 465 ntTSL 411.6□□□□□ -0.551e-10■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.565e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 CTSB-211ENST00000526481 660 ntTSL 511.51□□□□□ -0.575e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-213ENST00000600019 1167 ntTSL 511.5□□□□□ -0.575e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-214ENST00000599719 1473 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.571e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.65e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-202ENST00000593345 933 ntTSL 310.97□□□□□ -0.655e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 PGGHG-206ENST00000476372 2879 ntTSL 210.96□□□□□ -0.665e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.675e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.685e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-209ENST00000598820 2615 ntTSL 210.58□□□□□ -0.725e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-211ENST00000599425 872 ntTSL 310.49□□□□□ -0.735e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 EIF5B-204ENST00000494190 664 ntTSL 210.47□□□□□ -0.735e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 LDHA-212ENST00000495052 682 ntTSL 510.46□□□□□ -0.731e-10■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.745e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.741e-10■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-218ENST00000601309 672 ntTSL 510.3□□□□□ -0.761e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.785e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.85e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 HSPH1-206ENST00000602786 3488 ntTSL 1 (best)10.05□□□□□ -0.85e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-206ENST00000594207 816 ntTSL 59.8□□□□□ -0.841e-8■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.885e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.885e-6■□□□□ 8.1
NIPBLQ6KC79 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.911e-10■□□□□ 8.1
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 490.4 ms