Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms