Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms