Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms