Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF220Q5VTB9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF220Q5VTB9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms