Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms