Protein–RNA interactions for Protein: Q5MIZ7

PPP4R3B, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R3BQ5MIZ7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R3BQ5MIZ7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms