Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms