Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms