Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC2HC1CQ53FD0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms