Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRNQ4KMQ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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