Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms