Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms