Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPROQ16827 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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