Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPP1R3AQ16821 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPP1R3AQ16821 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms