Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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