Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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