Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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CTF1Q16619 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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CTF1Q16619 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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