Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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